Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms