Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms