Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms