Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TriobpQ99KW3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms