Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms