Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms