Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krcc1Q99JT5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krcc1Q99JT5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms