Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms