Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Sfxn4Q925N1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfxn4Q925N1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms