Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim7Q923T7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms