Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms