Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NelfcdQ922L6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms