Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms