Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nek8Q91ZR4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek8Q91ZR4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms