Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atl3Q91YH5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl3Q91YH5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms