Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ2

Pcdhb8, Protocadherin beta-8, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb8Q91XZ2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdhb8Q91XZ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcdhb8Q91XZ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms