Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms