Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms