Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms