Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mark1Q8VHJ5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms