Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms