Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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