Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms