Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms