Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd8Q8R3B7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd8Q8R3B7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms