Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CipcQ8R0W1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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