Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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