Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms