Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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