Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms