Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trappc12Q8K2L8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc12Q8K2L8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms