Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms