Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hacd3Q8K2C9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms