Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms