Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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