Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Nek9Q8K1R7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Nek9Q8K1R7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Nek9Q8K1R7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek9Q8K1R7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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