Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms