Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W9

Dph3, DPH3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph3Q8K0W9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Dph3Q8K0W9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Dph3Q8K0W9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms