Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip10Q8CJ53 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms