Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mterf1aQ8CHZ9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Mterf1aQ8CHZ9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms