Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CherpQ8CGZ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CherpQ8CGZ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CherpQ8CGZ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CherpQ8CGZ0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CherpQ8CGZ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms