Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ercc8Q8CFD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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