Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms