Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras1Q8CEC5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras1Q8CEC5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms