Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc73Q8CDM4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms