Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atad2Q8CDM1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atad2Q8CDM1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms