Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms