Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo43Q8CDI2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms