Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms