Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms